每年梅雨季節會持續10-20天，在這段時間里往往連續陰雨，出現雷雨和悶熱天氣，氣壓較低，水產養殖動物排泄物也增多，水質極易惡化，因此特別容易缺氧，同時因為高溫和低氧，也很容易引發水生動物疾病。主要采取以下幾點措施：
一、注意水質調控
1．經常開啟增氧機，特別是晚上和后半夜。遇到陣雨、連續悶熱或天氣突變的情況，開機時間要延長，并配合使用增氧劑。對蝦池中，應盡可能2-3天使用一次增氧劑。
2．沒有增氧機的池塘，建議每隔3-5天使用一次增氧劑，在后半夜使用效果*，以增加池底溶氧，減少池底有害物產生。養殖密度較大、水質不穩定的，應增加使用頻率。
3．使用底質改良劑改善底質，同時配合增氧劑使用，每7-10天使用1次，能消除底部有機質分解產生的有害物，并能抑制病菌繁衍，保持底質良好，防止水質惡化。并在不下雨的上午使用1-2次EM菌。
4．使用水質改良劑來改良水質，減少池水有機質含量，防止水質惡化，增加透明度，還能促進藻類生長。養殖密度比較大、池水比較深的池塘，還應適當潑灑石灰乳，每畝每米水深使用4-5千克。方法是將生石灰化水后全池潑灑，能防止水體因水產動物大量呼吸作用、藻類光合作用弱導致的水體變酸。PH值高的池塘無須進行潑灑。
二、確保飼料質量，控制投飼量
　　要確保飼料新鮮，河蟹養殖要減少冰鮮餌料的投喂，以免污染水質。投喂量要根據天氣、水質變化和實際攝食情況靈活掌握，遇悶熱、下雨天氣應減少投喂量，以免殘餌大量積累，敗壞底質。梅雨季節的投喂量一般掌握在魚蝦蟹吃到七成飽即可。飼料應注意貯存條件，防止霉變，一次采購的量不要太大。
三、做好疾病預防，控制疾病發生
　　處理方案為：在入梅前一個禮拜選擇天氣好的時機殺蟲1次，第二天消毒1次。殺蟲消毒后的第二天，再使用1次底質改良劑配合增氧劑，消除有害物，在第3-4天，使用芽孢桿菌來穩定水環境。這樣就為入梅創造了一個好的條件。
　　在梅雨期間可選擇：Vc、大蒜素、生物制劑、中藥保肝利膽藥物和三黃粉、多糖等。每次添加2-3天，每7-10天添加1次。以便改善養殖動物消化吸收能力，增加抗應激能力和抗病能力。
四、加強日常管理，保證魚蝦的健康生長
　　黃梅天應加強巡塘，發現異常及時采取應對措施。如發現缺氧泛塘，要立即開啟增氧機，并立即拋灑增氧劑。輕微浮頭或沒有增氧機的，在使用粉劑增氧劑的同時配合使用顆粒增氧劑。水產養殖動物攝食后應盡可能清掃食場或撈出殘渣。若養殖中出現死亡情況，首先進行環境改善，比如增氧，然后咨詢當地漁技人員，選擇恰當的處理方案。